From itoshi ＠ saitama-med.ac.jp Tue Jan 31 20:24:11 2006 From: itoshi ＠ saitama-med.ac.jp (Itoshi NIKAIDO) Date: Tue, 31 Jan 2006 20:24:11 +0900 Subject: [Knob-dev 42] =?iso-2022-jp?b?GyRCTVdLPiVqJTklSBsoQg==?= Message-ID: にかいどうです。 前回のKNOBで要望を受けたことをメモした ものを発見しました。参考までに送ります。 実現できるものはなるべくしたいですね。 1. バージョンがわかるようにする バージョンによってソフトの構成が違うため、 サポートの際にバージョンを聞く必要があるが、 現在のKNOBでバージョンを明示的に知る方法が ない。 $ cd ~/ $ touch KNOB2.0.0 とかしておけばいいと思う。 2. PyMOLのGUI動作に必要な pythonのdistutils.spawnがない 3. EMBASSYがない EMBOSSが必要とするサードパーティのソフト群をこう呼ぶが それがすべて入っている訳ではない。よって、依存するEMBOSS のプログラムの一部が動かない 4. Ruby/Perlのライブラリ mysql, BDB, DBI, XML周りのライブラリを充実させてほしい。 5. EMBOSSのデータをいれてほしい PROSITEやREPEATのデータベースを入れてほしい。これは 容量と相談か? 6. UNIONFSへの対応 足りないライブラリなどを自分で足せるので。 7. emboss.defaultのデータベース名の改善 GENBANKN とあるがタンパク質もとれる。URLもより適切な ものがあるのでは? -- Itoshi NIKAIDO, Ph.D.