From dritoshi ＠ gmail.com Sun Feb 25 00:09:35 2007 From: dritoshi ＠ gmail.com (Itoshi NIKAIDO) Date: Sun, 25 Feb 2007 00:09:35 +0900 Subject: [Knob-dev 137] Re: knob 3.0 dvd test ver. In-Reply-To: <45DEF1E9.8B9804B@ssl.fujitsu.com> References: <45DEF1E9.8B9804B@ssl.fujitsu.com> Message-ID: にかいどうです． 佐藤先生へメールしておきました．少なくとも僕の環境では起動しました． Jalview など Javaのツール群が使えるようになっているのは嬉しいですね． On 2/23/07, Go Yamamoto wrote: > 二階堂先生 > > 山本です。おつかれさまです。 > > shell.sourceforge.jp:/misc/groups/k/kn/knob/htdocs/knob30b1_dvd_070219.iso > に KNOB の DVD 起動検証用のイメージをアップしました(まだ beta > レベルに達していません)。 > > お手数をおかけして申し訳ありませんが、参照可能なディレクトリへ > 移動していただけませんでしょうか? > > 佐藤先生にご連絡しつつ、ダウンロードが困難等の場合はこちらから > DVD をお送りして jaist で起動できることをご確認いただきたいと > 考えています。 > > お忙しいところ申し訳ありませんが、よろしくお願いします。 > > -- > 山本 剛(ごう) E-mail: gyama ＠ ssl.fujitsu.com > _______________________________________________ > Knob-dev mailing list > Knob-dev ＠ lists.sourceforge.jp > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-dev > -- Itoshi NIKAIDO, Ph.D. FF20 8296 ED6F D9E5 7D05 8A0F 65D8 C2F5 C8D7 2CE2 From gyama ＠ ssl.fujitsu.com Sun Feb 25 02:49:11 2007 From: gyama ＠ ssl.fujitsu.com (gyama ＠ ssl.fujitsu.com) Date: Sun, 25 Feb 2007 02:49:11 +0900 Subject: [Knob-dev 138] Re: knob 3.0 dvd test ver. References: <45DEF1E9.8B9804B@ssl.fujitsu.com> Message-ID: <45E07A97.5468D0CA@ssl.fujitsu.com> 山本です。こんばんは。 Itoshi NIKAIDO wrote: > > 佐藤先生へメールしておきました．少なくとも僕の環境では起動しました． ご確認、ご連絡ありがとうございます。 なお、こちらでも起動は確認していますが、個々のツールに関しては まだ動作確認できていません。最低限 BioConductor は必要でしょうか。 > Jalview など Javaのツール群が使えるようになっているのは嬉しいですね． DVD は容量が大きいのがありがたいです。 あと RoR が未収録ですが、今回ちょっと間に合わなかったのですが 次の版で入ります。 ついでで申し訳ありませんが、リマスタツール(EZ Tune LiveCD と名づけました) のマニュアルを下記にて公開しました。 http://ez-tune-livecd.sourceforge.jp/pukiwiki/index.php?1.0%A5%DE%A5%CB%A5%E5%A5%A2%A5%EB > On 2/23/07, Go Yamamoto wrote: > > 二階堂先生 > > > > 山本です。おつかれさまです。 > > > > shell.sourceforge.jp:/misc/groups/k/kn/knob/htdocs/knob30b1_dvd_070219.iso > > に KNOB の DVD 起動検証用のイメージをアップしました(まだ beta > > レベルに達していません)。 > > > > お手数をおかけして申し訳ありませんが、参照可能なディレクトリへ > > 移動していただけませんでしょうか? > > > > 佐藤先生にご連絡しつつ、ダウンロードが困難等の場合はこちらから > > DVD をお送りして jaist で起動できることをご確認いただきたいと > > 考えています。 > > > > お忙しいところ申し訳ありませんが、よろしくお願いします。 > > > > -- > > 山本 剛(ごう) E-mail: gyama ＠ ssl.fujitsu.com > > _______________________________________________ > > Knob-dev mailing list > > Knob-dev ＠ lists.sourceforge.jp > > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-dev > > > > -- > Itoshi NIKAIDO, Ph.D. > FF20 8296 ED6F D9E5 7D05 8A0F 65D8 C2F5 C8D7 2CE2 > _______________________________________________ > Knob-dev mailing list > Knob-dev ＠ lists.sourceforge.jp > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-dev -- gyama ＠ ssl.fujitsu.com From dritoshi ＠ gmail.com Sun Feb 25 11:59:57 2007 From: dritoshi ＠ gmail.com (Itoshi NIKAIDO) Date: Sun, 25 Feb 2007 11:59:57 +0900 Subject: [Knob-dev 139] Re: knob 3.0 dvd test ver. In-Reply-To: <45E07A97.5468D0CA@ssl.fujitsu.com> References: <45DEF1E9.8B9804B@ssl.fujitsu.com> <45E07A97.5468D0CA@ssl.fujitsu.com> Message-ID: にかいどうです． On 2/25/07, gyama ＠ ssl.fujitsu.com wrote: > まだ動作確認できていません。最低限 BioConductor は必要でしょうか。 そうですね．Open-Bioまでは，BioRuby, G-language, ChemRuby, R + BioConductor, EMBOSS とそれぞれに必要になるプログラムが 最低欲しいところです．無理なら R + BioCだけでもいいです． Rを起動して， source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R") biocLite(groupName="all") としてください． > > Jalview など Javaのツール群が使えるようになっているのは嬉しいですね． > > DVD は容量が大きいのがありがたいです。 > あと RoR が未収録ですが、今回ちょっと間に合わなかったのですが > 次の版で入ります。 承知しました．あと，KNOBにも EZ Tune LiveCDを入れることは可能ですか? > ついでで申し訳ありませんが、リマスタツール(EZ Tune LiveCD と名づけました) > のマニュアルを下記にて公開しました。 すばらしい! これは正式公開ですか? もし正式公開なら宣伝します． すでに遅いですが，名前は，Ez create Live CD として略称が， EZ Create LivEcd = ezcle で，いぢくる はありかな，と思いました． Live CD をいぢくり倒すには，ふさわしい名前かもしれません． ちなみに，発音はオラクルみたいに発音します．プレゼンのときに 発音するのがちょっと恥しいかもしれませんw Google でもほとんどヒットしません (これ重要) > ezcle # Ez が au っぽいのがよいのかな?，とは思いましたがw -- Itoshi NIKAIDO, Ph.D. FF20 8296 ED6F D9E5 7D05 8A0F 65D8 C2F5 C8D7 2CE2 From gyama ＠ ssl.fujitsu.com Sun Feb 25 21:27:35 2007 From: gyama ＠ ssl.fujitsu.com (Go Yamamoto) Date: Sun, 25 Feb 2007 21:27:35 +0900 Subject: [Knob-dev 140] Re: knob 3.0 dvd test ver. References: <45DEF1E9.8B9804B@ssl.fujitsu.com> <45E07A97.5468D0CA@ssl.fujitsu.com> Message-ID: <45E180B7.4C213452@ssl.fujitsu.com> 山本です。こんばんは。 Itoshi NIKAIDO wrote: > > そうですね．Open-Bioまでは，BioRuby, G-language, ChemRuby, > R + BioConductor, EMBOSS とそれぞれに必要になるプログラムが > 最低欲しいところです．無理なら R + BioCだけでもいいです． インストールはされている(はずです)ので要確認ですね。 今年もギリギリになってしまいそうなので、こちらで DVDを焼こうと 思いますが、去年は何枚焼いていただいたのでしょう。 > 承知しました．あと，KNOBにも EZ Tune LiveCDを入れることは可能ですか? もちろんです。 どうもありがとうございます。喜んで入れさせていただきます。 > すばらしい! これは正式公開ですか? もし正式公開なら宣伝します． まだ若干直しが入ります。 Googlebot が来てインデックス化されるのを待っているのですが、 気配が無い?ので 2/28 を正式公開とさせてください。 といってもすでに見えている状態なので、お時間のあるときにいつでも 宣伝していただければと思います。ありがとうございます。 > EZ Create LivEcd = ezcle で，いぢくる はありかな，と思いました． > Live CD をいぢくり倒すには，ふさわしい名前かもしれません． > ちなみに，発音はオラクルみたいに発音します．プレゼンのときに > 発音するのがちょっと恥しいかもしれませんw 想像しただけで、けっこう恥ずかしいです。(^^;; ではアイデアをお借りして EZ TunE LiveCD で EZTE LiveCD(いじって LiveCD) とでもしましょうか(苦しい)。 Create は 1からディストリビューションをスクラッチする機能は ないので没にしました。 > # Ez が au っぽいのがよいのかな?，とは思いましたがw 初期の案の Tunes LiveCD は iTunes の typo を狙うつもりだったのは ナイショですｗ -- 山本 剛(ごう) E-mail: gyama ＠ ssl.fujitsu.com